Для АМ старого образца контроль на остатках осуществляется только если у товара загружен соответствующий признак:
<plugin-property key="check-on-remains" value="true" />
Подробнее описано в интеграционной документации
Если признак на товар не загружен (по умолчанию он выключен), то SetMark будет регистрировать продажи старых АМ, даже если их нет на остатках.
...